本文作者:qiaoqingyi

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qiaoqingyi 2023-01-20 901

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meme suite —— Motif分析百宝箱(二)

Motif Discovery中还包括MEME-ChIP,可对ChIP-seq或CLIP-seq数据的DNA序列进行一系列的Motif分析。该方法整合了:

1、MEMESTREME功能,用以预测Motif(de novo Motif);

2、CentriMo用以寻找输入序列中间区段内已知的Motif,适合ChIP-Seq数据检出峰所在序列上富集的已知 Motif;

3、通过工具Tomtom功能比较已知的motif进行相似性分析,并对重要的motif进行分组;

4、Spamo与CentriMo功能相似,也是对Motif进行富集;

5、FIMO功能旨在输出Motif在基因的位置信息。

MEME-ChIP具体参数可以使用默认值,或按需求更改。示意图如下:

我们以网站Sample Output中MEME-ChIP example结果为例进行说明。

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国际贸易实务思政化教学改革理论依据主要涉及四个方面。首先,结合建构主义学习观,从国际贸易实务的课程学习来看,学生在学习过程中应该主动去构建信息,这样才能激发学生的内在驱动力,同时,通过挖掘国际贸易实务中的思政因素,将国际贸易实务的专业知识技能与真实情境中的人文社会活动有效结合;其次,基于实用主义的教育理论,将国际贸易实务的专业知识与学生的实际生活产生链接,生活即教育,要让学生掌握知识迁移的能力,从实际生活教育角度出发,内化学生的成长;再次,成果导向的教育明确指出,教学过程中的教学设计和教学实施目标都应以学生最终的学习成果为中心,制定教学方案并持续改进。国际贸易实务的课程学习最终要达到的学习成果应是学生的专业知识技能与思政双全,因此,在教学目标和教学活动的设计上都要增加思政化目标,站在学生的角度,以学生的实际需求为出发点,构建多维度学习要素,使学生从中能够挖掘自身价值,完成自我目标;最后,基于人的全面发展理论,国际贸易实务课程应在注重学科教学基础上同步提升学生的态度及道德等综合素养,才符合当今教育的思政化趋势,才能培养出知识技能与道德修养双修的复合型人才。

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